双侧输卵管堵塞的试管婴儿并不能完全避免宫外孕的风险，因为胚胎移植后可能在子宫腔内游荡，需要寻找最合适的地方着床。但是，由于一些患者，特别是子宫环境差、子宫内膜薄、一些有少量宫腔粘连、子宫腺肌症或子宫肌瘤的患者，胚胎也可能在子宫腔外徘徊，如输卵管。如果胚胎发育到一定程度，没有及时游回子宫腔找到合适的环境着床，就会造成宫外孕。
因此，一旦通过试管婴儿检测出怀孕，也应排除宫外孕的可能性，并定期监测HCG和孕酮，观察其数值的倍增情况。如果HCG和孕酮的倍增不明显，应排除胚胎发育不良、生化妊娠、先兆子痫、流产以及最重要的宫外孕的可能性。因此，不管是试管婴儿还是自然受孕，都应及时排除宫外孕的发生。
试管婴儿中宫外孕的原因。
1.胚胎游走
即使胚胎进入了子宫腔，胚胎仍然在子宫腔内游荡。如果输卵管出现异常，如炎症、狭窄或过于纤细，就可能发生宫外孕。
2. 子宫腔环境不好
如盆腔炎（输卵管炎、输卵管积水等）是宫外孕的主要因素。
3、胚胎移植的操作不当
注射速度和压力过大；注射液过多；使用的移植管柔软度不够等，都可能导致宫外孕。
4、子宫内膜蠕动
胚胎进入子宫腔后，在一定位置与子宫内膜接近。由于胚胎本身发生的机械压力和子宫平滑肌的蠕动相互配合，胚胎可以被放置在子宫角腔内的适当位置。